נשיא האיגוד ייבחר בבחירות אלקטרוניות, ברוב רגיל של הנוכחים בעלי זכות הצבעה, לכהונה בת שלוש שנים.
מתפקידו לייצג את האיגוד בפני גורמים שונים בארץ ובחו"ל, לכהן כיו"ר ועד האיגוד ולהיות אחראי לפעילויות האיגוד למיניהן. בהעדרו ימלא את מקומו מזכיר האיגוד.
אם נשיא האיגוד יתפטר טרם תום תקופת כהונתו או אם נבצר ממנו למלא את תפקידו, יפורסם קול קורא לבחירה אלקטרונית בתוך 30 יום לבחירת נשיא חדש.